Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1189978 1190025 48 66 [0] [0] 101 phoQ sensory histidine kinase in two‑compoent regulatory system with PhoP

Only 100 of 101 total aligned reads displayed.

CCTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTA  >  W3110S.gb/1190026‑1190089
|                                                               
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:394690/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:648119/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:618656/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:576572/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:57029/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:537549/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:533136/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:517583/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:512896/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:500795/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:498069/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:470394/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:439720/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:67540/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:363340/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:362143/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:338193/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:274433/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:266002/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:253383/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:188486/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1875965/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1858997/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1854721/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:183631/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:823958/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:984661/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:967192/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:965717/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:940502/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:928481/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:913090/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:869020/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:847286/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:84642/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:84284/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:830516/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:828617/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1834025/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:816429/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:790159/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:775782/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:774783/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:773483/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:760977/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:758127/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:718557/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:715175/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:708092/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:678153/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1261530/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1446639/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1418782/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1417900/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1415913/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1406711/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1400919/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1391901/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1367770/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1365798/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1353029/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1319462/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1286808/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:149224/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1240992/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1228670/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1218886/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1201896/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1177526/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1147591/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1133007/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1126541/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1122437/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1110813/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1101699/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1599652/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1817266/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1808555/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:18026/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1742977/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1739615/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1729042/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1707034/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1666739/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1652942/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1643230/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1628786/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1609646/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1035991/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1585479/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1584685/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1566042/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1553612/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1546381/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1534744/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1534407/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1510298/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1506259/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1504198/64‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTa  <  1:1503315/64‑1 (MQ=255)
|                                                               
CCTTGCCCAGGGCGTAAAGTATCAACCCGTTGACCACGGTCGAAAATGACCTCTCGCTTGCTTA  >  W3110S.gb/1190026‑1190089

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑