Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1203886	1203901	16	4 [0]	[0] 25	ymfK	repressor protein phage e14

ACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATA  >  W3110S.gb/1203902‑1203955 |                                                      aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:179336/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:759258/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:751073/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:737504/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:718365/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:640293/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:479028/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:468495/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:390889/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:306650/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:292217/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:238015/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1818032/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1005644/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1788940/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1773232/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1767083/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1668523/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1653255/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1521088/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:146188/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:128945/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1217260/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1206242/54‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATa  <  1:1138759/54‑1 (MQ=255) |                                                      ACCGTTGATCTTAATGTAAGGCTCAGGCCAGTTTGGGTTTAACGCTTTGAGATA  >  W3110S.gb/1203902‑1203955

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑