Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1204138	1204195	58	6 [0]	[0] 88	ymfK	repressor protein phage e14

TTCTTTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGA  >  W3110S.gb/1204196‑1204260 |                                                                 ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTGCCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:988749/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:374194/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:580862/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:580626/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:580012/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:574980/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:536330/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:521022/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:488266/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:447917/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:391376/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:382951/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:631405/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:341005/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:330090/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:32177/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:237475/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:216253/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:212205/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1883755/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1002254/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1862374/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:78592/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:990149/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:984006/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:946273/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:94558/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:917371/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:907590/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:894013/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:866108/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:851277/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:84496/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:583540/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:752289/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:746565/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:718476/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:694481/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:692602/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:681834/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:664581/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:65921/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1877914/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1129819/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1837261/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1251755/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1246237/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1234339/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1231575/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:122281/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1195450/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1192110/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1168419/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1137265/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:12794/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1129344/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1119569/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1117643/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1116931/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1114728/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:109666/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1075979/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1058550/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1007751/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1002905/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1339649/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1798759/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1778795/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1722473/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1698489/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1691653/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1642007/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1634308/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1616278/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1611548/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1600270/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1599934/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1595168/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1540688/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1497905/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1436563/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1342896/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1303915/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTCATTAGTGa  <  1:396330/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGCGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:812630/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATATGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1618660/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCGGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGa  <  1:1498450/65‑1 (MQ=255) ttcttTCCATGCTCCGGCCCGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTCGTGa  <  1:800274/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TTCTTTCCATGCTCCGGCCTGTACCCATGATATGACAGGGACTAATGTGATTTGTTTATTAGTGA  >  W3110S.gb/1204196‑1204260

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑