Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1213335 1213515 181 101 [0] [1] 140 elbA hypothetical protein

Only 100 of 140 total aligned reads displayed.

CCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAT  >  W3110S.gb/1213515‑1213580
 |                                                                
ccATATGGCTGAAAAAGATTACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:985736/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGATAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:474559/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCac  <  1:1709169/65‑2 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:50871/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1860591/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:507132/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:495042/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:490581/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:473418/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:460111/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:411166/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:391404/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:35059/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:34849/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:342343/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:337915/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:326332/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:313304/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:298563/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:27996/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:262331/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:260244/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:236670/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:200924/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1883219/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1856857/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:803826/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:975885/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:960004/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:951314/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:945929/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:921632/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:905080/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:882295/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:878626/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:861223/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:848379/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:831837/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:814569/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:516561/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:800132/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:771812/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:748461/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:718381/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:674678/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:67385/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:65251/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:640106/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:59652/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:595107/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:532148/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1209571/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:146122/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1418031/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1414786/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1414249/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1405294/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1358361/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1275505/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1268763/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1259364/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1251527/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1248789/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1515618/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1201975/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1175620/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1145293/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1144793/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1097227/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1082297/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:107202/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1047839/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1047088/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1023107/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1019911/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1689887/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1840393/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1840007/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1835281/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1803919/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1779964/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1765626/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1733043/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1728824/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1723928/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1720062/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1719251/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1015897/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1674386/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1664020/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1654035/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1628153/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1622168/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1606670/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1585225/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1567144/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1529812/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1522085/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAAATACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1835375/65‑1 (MQ=255)
 cATATGGCTGAAAAAGAAATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt  <  1:1499246/65‑1 (MQ=255)
 |                                                                
CCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAT  >  W3110S.gb/1213515‑1213580

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: