Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1213581	1214117	537	146 [0]	[0] 39	elbA/ycgX	hypothetical protein/hypothetical protein

CACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGAT  >  W3110S.gb/1214118‑1214157 |                                        cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:596614/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:237549/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:2700/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:270729/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:301254/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:39859/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:449689/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:465486/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:465917/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:515308/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:216313/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:603755/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:760411/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:771880/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:801332/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:809977/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:879008/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:963528/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:966050/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:996580/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1836024/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1087808/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:111486/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1126462/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1232476/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1240756/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1262519/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:126449/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:146273/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1498192/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1519195/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1536852/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1549827/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1658516/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1749557/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1803430/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:1824126/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGat  <  1:102822/40‑1 (MQ=255) cacaTTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGAGat  <  1:1048706/40‑1 (MQ=255) |                                        CACATTTCAAATATCAAGTTGATAGTATTAGTCTGGTGAT  >  W3110S.gb/1214118‑1214157

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑