Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1218763	1218847	85	81 [0]	[0] 64	ymgC/ycgG	hypothetical protein/conserved inner membrane protein

AGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAA  >  W3110S.gb/1218848‑1218912 |                                                                 aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:696046/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:278622/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:290089/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:349527/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:394057/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:412455/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:414124/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:47163/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:503409/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:508725/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:515391/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:614721/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:615089/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:648983/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:660668/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:670475/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:261053/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:712077/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:732918/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:735358/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:744694/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:7538/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:754722/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:768068/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:801638/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:839687/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:866771/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:879119/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:89049/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:904951/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:911704/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:919391/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1572645/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1072578/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1106097/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1112258/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1163166/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1184123/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1195049/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1221805/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1262068/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1270702/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1324161/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:135894/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1374501/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1397826/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1408084/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:153367/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1023614/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1574726/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:15892/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1597355/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1610527/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1620870/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1691984/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1772402/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1797410/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1801817/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1806216/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1838978/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1841151/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:187983/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:257569/65‑1 (MQ=255) aGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTCCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCaa  <  1:1812843/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AGCGCGAGCGAATGAATGGCATTTTCATGTATTAAACCCTTTGGCCGGGACAAGCAAATGCGCAA  >  W3110S.gb/1218848‑1218912

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑