Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1228849	1228859	11	8 [0]	[0] 43	ycgK	hypothetical protein

CATGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCG  >  W3110S.gb/1228860‑1228924 |                                                                 caTGCACTTTCTGCCCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:177463/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGCCCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:583317/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTTTATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:207838/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGt                           >  1:1675397/1‑40 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTatcgta                     >  1:1629914/1‑46 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTGTCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1028266/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTc   >  1:1035243/1‑64 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTc   >  1:1148322/1‑64 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTc   >  1:210226/1‑64 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTc   >  1:1789415/1‑64 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTc   >  1:744992/1‑64 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTc   >  1:682148/1‑64 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:290262/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:331016/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:636701/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:287930/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:274660/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:553599/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1865201/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:75979/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:800961/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:831323/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:844318/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:861311/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:922563/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:989610/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1567635/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1033985/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1150857/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1281409/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1331340/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1489576/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1499811/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1543483/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:221420/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1652361/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1672989/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1787849/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1797494/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1823311/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCg  >  1:1872617/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAAACGTATCCCTTTATTTCg  >  1:304825/1‑65 (MQ=255) caTGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGGATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTAttt    >  1:1273913/1‑63 (MQ=255) |                                                                 CATGCACTTTCTGACCTTTTTTGGCATAGAAGGTATATGTATCGTAATCGTATCCCTTTATTTCG  >  W3110S.gb/1228860‑1228924

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑