Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1245408	1245611	204	22 [0]	[0] 41	ycgR	protein involved in flagellar function

CTTGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAC  >  W3110S.gb/1245612‑1245676 |                                                                 cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCAt                        >  1:1144834/1‑43 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATa   >  1:1882717/1‑64 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATa   >  1:495260/1‑64 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:720516/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:424498/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:432311/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:507421/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:546656/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:551481/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:655049/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:665793/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:687887/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:329691/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:721208/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:73586/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:794363/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:811871/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:835006/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:864583/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:885742/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:91484/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:938774/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1410738/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1070988/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1090018/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:114558/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1148606/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:116135/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1167431/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1192201/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1218087/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:136202/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:39397/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:162700/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:16495/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1673766/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:170092/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1710457/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:180857/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1836972/1‑65 (MQ=255) cttGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAc  >  1:1067930/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CTTGTAATTCGGCAGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATAC  >  W3110S.gb/1245612‑1245676

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑