Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1278803	1278933	131	125 [0]	[0] 99	narX	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL

GAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTT  >  W3110S.gb/1278934‑1278998 |                                                                 gAGTCAACTCGGCGTTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1176310/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTttaattaa                     >  1:1026411/1‑46 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAg                    >  1:1579628/1‑47 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTg              >  1:1223361/1‑53 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTtct       >  1:1753271/1‑60 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGc    >  1:45667/1‑63 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:609550/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:612006/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:609288/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:587253/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:558514/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:539679/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:52204/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:491514/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:468521/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:450998/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:383183/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:371307/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:347302/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:345694/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:333693/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:316123/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:292268/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:277290/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:252197/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:232638/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:232446/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:223676/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:78021/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:984614/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:955046/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:922299/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:917957/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:90752/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:90203/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:844154/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:831641/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:830577/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:821388/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:815808/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:610369/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:727742/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:72322/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:721225/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:710573/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:692062/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:672391/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:653522/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:651717/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:650292/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:638745/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1855982/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1204092/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1475003/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1351265/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1317937/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1260378/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1258600/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1255012/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:125341/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1252773/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1232796/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1209582/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1500151/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1191209/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1189280/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1151501/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1144070/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1079272/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1052780/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1042533/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1036738/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:102519/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1016193/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1686053/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:197532/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:188926/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1007484/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1854555/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1844213/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1813773/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1808005/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1763568/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1761518/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1759457/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:175429/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1719237/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1506183/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1683351/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1625622/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1622606/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1608760/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1585534/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1543330/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1539883/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:1512667/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCt   >  1:1380355/1‑64 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTACTCGCtt  >  1:1297927/1‑65 (MQ=255) gAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTATTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCtt  >  1:201842/1‑65 (MQ=255) |                                                                 GAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTT  >  W3110S.gb/1278934‑1278998

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑