Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 1296503 | 1296515 | 13 | 11 [0] | [0] 36 | ychG ychG |
ECK1234:JW1227:b1239; hypothetical protein, C‑ter fragment ECK1234:JW5883+JW1227:b4573; hypothetical protein |
AAAAAGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTG > W3110S.gb/1296516‑1296580 | aaataGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:496793/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:624295/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1007620/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1766041/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1830902/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1847915/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:303627/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:327903/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:399468/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:173987/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:666383/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:711881/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:765982/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:810239/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:884100/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:935033/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:967666/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:973773/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1726644/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:113572/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1136417/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1163896/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1285855/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1289607/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1291630/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1335953/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1359709/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1386756/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1447081/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1512280/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1608418/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1610510/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1673174/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1734587/65‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGGCTg < 1:770156/65‑1 (MQ=255) aaaaaGCTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTg < 1:1048162/65‑1 (MQ=255) | AAAAAGTTGCAGGCCGTGCCAGTCATCCTTCAGGTAACGTTCCGCGCCCCTGTCTGTGCGGTCTG > W3110S.gb/1296516‑1296580 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |