Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1332409	1332473	65	18 [0]	[0] 58	yciN/topA	hypothetical protein/DNA topoisomerase I, omega subunit

CTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTC  >  W3110S.gb/1332474‑1332537 |                                                                cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTAt                       >  1:1525911/1‑43 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCttac  >  1:575224/1‑62 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:526495/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:336508/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:357121/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:400556/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:402989/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:40413/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:410426/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:441439/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:441883/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:464328/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:46467/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:508948/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:515695/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:521854/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:52316/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:328863/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:55968/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:645556/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:674497/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:757411/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:791913/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:812434/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:909222/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:911956/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:920844/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:932965/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:975989/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:988493/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1546946/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:108543/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1093834/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1118460/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1124543/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1127276/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1243396/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1322181/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1326469/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1331276/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1416311/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:142933/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1470773/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1483612/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1006533/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1649486/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1739213/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1767435/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1776573/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1843366/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:186282/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1871494/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:1875346/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:195788/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:302056/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:302747/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:32613/1‑64 (MQ=255) cTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATGTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTc  >  1:279843/1‑64 (MQ=255) |                                                                CTTTGGATTTTGCATGCTAATAAAGTTGCGTATCGGATTTTATCAGGTACAGTGTGACGCTTTC  >  W3110S.gb/1332474‑1332537

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑