Missing coverage evidence...
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CGCTTCCGCTTCCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTGCG  >  W3110S.gb/1439325‑1439368 |                                            cgcttccggttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:453641/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTtcg  <  1:240994/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:314680/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:940955/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:924519/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:901967/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:823144/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:792934/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:79105/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:500664/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:467012/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:443710/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:42720/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:339348/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:1133543/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:276241/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:196550/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:1872612/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:1856753/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:1697473/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:1668267/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:1515695/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:1437851/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:1366155/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:1364997/44‑1 (MQ=255) cgcttccgcttcCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTgcg  <  1:120274/44‑1 (MQ=255) |                                            CGCTTCCGCTTCCTGAATCGCTTTCACCGTCTGGTTCAGCTGCG  >  W3110S.gb/1439325‑1439368

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑