Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1456328	1456469	142	6 [0]	[0] 53	paaA	predicted multicomponent oxygenase/reductase subunit for phenylacetic acid degradation

AGAGGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGCC  >  W3110S.gb/1456470‑1456534 |                                                                 agagGCTCGACGCCAATCGTAATGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:697330/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:48589/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1671533/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1737744/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1803160/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1832011/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1879511/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:193573/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:203148/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:284205/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:301788/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:312830/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:36134/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:466372/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1643569/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:531980/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:697632/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:698261/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:712258/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:725559/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:82635/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:84979/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:854619/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:92814/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:939789/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:952659/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1482375/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:112773/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1145462/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1164433/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1165641/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1182881/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1236752/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:138189/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1386239/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1422390/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1431719/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1436688/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1454462/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1457313/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1008048/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1492966/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1517743/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1524535/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1538443/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1547048/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1594092/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1615924/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1617301/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACCCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1637617/65‑1 (MQ=255) agagGCTCGACCCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1639670/65‑1 (MQ=255) agagGCGCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1615629/65‑1 (MQ=255) agagGCGCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGcc  <  1:1648915/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AGAGGCTCGACGCCAAACGTAAAGCCTGGGAAGAAGGTACCTGGGTACGGGAAGCAGCGCTGGCC  >  W3110S.gb/1456470‑1456534

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑