Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1473536	1473624	89	39 [0]	[0] 40	ydbA ydbA	ECK1398:JW5802+JW1402:b4492; predicted outer membrane protein ECK1398:JW1402:b1405; predicted outer membrane protein, C‑ter fragment

GGGATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGA  >  W3110S.gb/1473625‑1473689 |                                                                 gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:660132/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1028608/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:298725/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:34279/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:393460/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:402111/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:507292/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:557439/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:601430/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:630969/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:215857/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:727119/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:764039/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:801009/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:833425/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:894843/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:904427/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:929236/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:9603/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:990816/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1886992/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:105949/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:109349/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1118535/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1154779/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1218466/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1263268/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:128822/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:130522/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:130644/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1454787/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1590095/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1667559/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1698462/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:173244/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1764790/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1821259/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:1883521/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGa  <  1:212438/65‑1 (MQ=255) gggATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAAAAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAActa  <  1:699702/65‑3 (MQ=255) |                                                                 GGGATGCTGGAAGTTAATAATAATTCAGCTTTCAATAACCGCGGCGAGTTTATTCTTGATAACGA  >  W3110S.gb/1473625‑1473689

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑