Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1474186	1474292	107	24 [0]	[0] 82	ydbA ydbA	ECK1398:JW5802+JW1402:b4492; predicted outer membrane protein ECK1398:JW1402:b1405; predicted outer membrane protein, C‑ter fragment

AGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATG  >  W3110S.gb/1474293‑1474357 |                                                                 aGGTATGAACGGTATCAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:167841/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATAc             >  1:515000/1‑54 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:506224/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:590671/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:578641/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:56843/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:54399/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:542626/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:522638/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:508414/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:649684/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:498539/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:493422/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:492150/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:491385/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:473280/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:470793/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:436500/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1003350/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:342693/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:750820/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:978886/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:924169/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:910689/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:898539/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:864188/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:852343/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:842479/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:824914/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:797351/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:342708/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:734210/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:732159/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:731977/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:720353/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:680890/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:675308/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:670039/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:662160/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1423409/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1574976/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1509626/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1474915/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1471524/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1471163/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1466479/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1462377/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1457339/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:145440/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:33815/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1414273/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:138963/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1298310/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1211225/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1190435/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1187092/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:108290/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1078891/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1783209/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:339595/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:322531/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:315213/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:306397/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:283488/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:2144/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:202981/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1879083/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1875365/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1820039/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:180437/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1788851/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1723804/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAt   >  1:500096/1‑64 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAt   >  1:1839016/1‑64 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAt   >  1:806964/1‑64 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAt   >  1:432269/1‑64 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAt   >  1:410102/1‑64 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAt   >  1:1112928/1‑64 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGAt   >  1:1067981/1‑64 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTAGCCGGAtg  >  1:1871301/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATAAAGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:1279792/1‑65 (MQ=255) aGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCAATATGGCGACTATACGTTGCCGGAtg  >  1:908135/1‑65 (MQ=255) |                                                                 AGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATG  >  W3110S.gb/1474293‑1474357

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑