Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1479686	1479690	5	95 [0]	[0] 40	ynbA	predicted inner membrane protein

GTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCG  >  W3110S.gb/1479691‑1479753 |                                                               gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:592413/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:188837/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:203203/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:309636/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:317222/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:408555/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:426984/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:51796/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:570036/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:581076/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1858735/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:690133/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:704952/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:829290/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:871964/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:880787/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:90265/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:9349/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:97039/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:995424/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1555090/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1044184/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1073778/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1136066/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1210804/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:130352/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1316619/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1324125/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1377723/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:144147/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1001198/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1559955/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:168745/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1711001/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1712555/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1755359/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1762894/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1786928/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1801837/63‑1 (MQ=255) gTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCg  <  1:1818422/63‑1 (MQ=255) |                                                               GTTATTTTGCACCATATTGACCGAGTTTTGCGGTTTACTCGCGCAGACGATTAACGGTGTTCG  >  W3110S.gb/1479691‑1479753

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑