Missing coverage evidence...
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TAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACCGCG  >  W3110S.gb/1540800‑1540864 |                                                                 tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGTTACACGTTGGc             >  1:1718802/1‑54 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGac         >  1:364342/1‑58 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGac         >  1:746788/1‑58 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCCCcgcg  >  1:1553401/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:599800/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1014876/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:190732/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:215220/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:260080/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:284583/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:369376/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:379023/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:419199/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:551005/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1870309/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:70865/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:713792/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:721880/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:747338/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:761050/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:829716/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:867077/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:890839/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:902848/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:953287/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1527581/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1334296/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1358593/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1384965/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1407650/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1424315/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1437678/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1507568/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1866426/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1261153/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1220769/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1530707/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1589686/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1720068/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:112209/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1785980/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1831233/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1110010/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgcg  >  1:1034621/1‑65 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgc   >  1:585113/1‑64 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgc   >  1:1509187/1‑64 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgc   >  1:419039/1‑64 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgc   >  1:346903/1‑64 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgc   >  1:1846283/1‑64 (MQ=255) tAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACcgc   >  1:1864566/1‑64 (MQ=255) |                                                                 TAATGCGTTCCTGGGCGTGATACATCATGGTCATGCCCGGCGGTACACGTTGGCTGACCACCGCG  >  W3110S.gb/1540800‑1540864

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑