Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1546933 1546941 9 123 [0] [0] 106 yddK hypothetical protein

Only 100 of 106 total aligned reads displayed.

CATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCA  >  W3110S.gb/1546942‑1547006
|                                                                
cATTATTATTCATATATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1061271/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTATATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1547111/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:322970/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:466934/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:466247/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:427773/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:421973/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:414032/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:399999/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:39492/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:384774/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:380345/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:374280/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:365993/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:576085/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:320421/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:309285/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:277309/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:277028/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:252889/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:243237/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:218068/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:193002/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1795216/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1765094/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1758469/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:729192/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:98203/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:950712/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:943974/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:933587/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:869228/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:818430/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:814896/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:812698/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:80897/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:789210/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:766439/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:759988/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:520169/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:726399/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:726190/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:690745/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:656710/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:654138/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:627277/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:615839/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:596269/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:593708/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:585488/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1751399/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1194104/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1378228/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1366582/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1364365/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1355443/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1347086/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1301627/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1291067/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1268115/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1226993/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1201812/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1199369/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1392516/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1171097/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1156302/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1149014/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1131101/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1128176/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1125212/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1106134/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1093361/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1085730/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1063062/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1045012/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1559006/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1732570/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1708886/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1696456/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1684323/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1656012/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1607641/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1595821/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1590396/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:159013/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1577575/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1562250/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1017080/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1551731/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1536161/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1534856/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1473059/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1466466/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1451867/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1438989/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1437969/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1427228/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1419506/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCa  <  1:1407244/65‑1 (MQ=255)
cATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATCGACTCa  <  1:796964/65‑1 (MQ=255)
|                                                                
CATTATTATTCATAGATATATGTGTAATACTTACATTTCTGCCTTGAGGAAAATTTATTGACTCA  >  W3110S.gb/1546942‑1547006

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: