Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1559420	1559723	304	67 [0]	[0] 37	ddpF	D‑Ala‑D‑Ala transporter subunit

TCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAGC  >  W3110S.gb/1559724‑1559788 |                                                                 tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCGCAgc  >  1:732901/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:787644/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:483616/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:533250/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:549178/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:554077/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:574866/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:612850/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:643198/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:711739/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:43016/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:808852/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:810872/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:824907/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:829760/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:83337/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:904688/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:951056/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:9526/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:356875/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1137192/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1164124/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1170260/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1276770/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1328401/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1328788/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:145701/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1508328/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1550218/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1721440/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1841032/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:243685/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:285793/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:297685/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1039910/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCAGATACCAACAGGCACAgc  >  1:1426270/1‑65 (MQ=255) tCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCAGCGGAAACCAACAGGCACAg   >  1:104108/1‑64 (MQ=255) |                                                                 TCGCGTAACGTTAATAACGTGTCAGACACTTATAACCTCCTGCTGCGGATACCAACAGGCACAGC  >  W3110S.gb/1559724‑1559788

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑