Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1564719	1564996	278	150 [0]	[0] 52	[ddpX]	[ddpX]

TGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCG  >  W3110S.gb/1564997‑1565061 |                                                                 tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGTGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:603866/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGATTTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:533583/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1869468/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1840209/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1875773/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:273762/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:291740/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:330696/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:34649/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:498915/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:527725/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:538892/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:569492/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:597717/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:664460/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:673938/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:691776/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:780858/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:811620/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:815708/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:840131/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:872257/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:962277/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:970300/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:971306/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:985417/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1417161/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1035907/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1065942/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1136879/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:115525/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1174531/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1273618/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1302467/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1314651/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:132056/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1326822/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1337154/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1344680/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1005019/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1472735/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1533178/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1539049/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1599746/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1651535/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1656709/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1664319/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:167427/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:169954/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1727625/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1761145/65‑1 (MQ=255) tGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCg  <  1:1791584/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TGACAGTGTCACGTTAAATGAAAACCCGCGAGTGCGGGCGAGAGGAATTTGTCAGATTTTCAGCG  >  W3110S.gb/1564997‑1565061

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑