Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1659191	1659368	178	66 [0]	[0] 54	[ynfD]	[ynfD]

AGCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGT  >  W3110S.gb/1659369‑1659433 |                                                                 agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCTAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1188151/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAGGTATTGt  <  1:1508750/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:647948/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:286498/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:393247/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:413055/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:42362/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:427420/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:460117/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:474853/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:502895/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:549761/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:562921/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:617401/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:629924/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1020830/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:659004/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:665697/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:710559/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:71977/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:746425/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:757031/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:842474/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:859129/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:86354/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:887674/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:918600/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:943741/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1836465/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1011202/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1039490/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1059495/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:108206/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1107983/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1112307/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1161242/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1251572/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1308586/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1370301/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1405157/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1429832/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1460784/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1481916/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1482683/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1498320/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1531482/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1642739/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1666212/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1692892/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1756157/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1759449/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:1811392/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGt  <  1:275042/65‑1 (MQ=255) agCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCAAGTTAAGTATTGt  <  1:981940/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AGCGATATATCACAGCGCATTATCAATAATGGCGTACCCGAAAGCAGCTTCACGTTAAGTATTGT  >  W3110S.gb/1659369‑1659433

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑