Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1668597	1669023	427	83 [0]	[0] 57	[ynfK]	[ynfK]

ATAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGAA  >  W3110S.gb/1669024‑1669088 |                                                                 aTAGCTCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:128542/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAAGAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1563838/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAATaa  <  1:2891/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:578504/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:359248/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:373648/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:389199/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:397781/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:419391/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:419521/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:424042/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:479069/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:485286/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:499069/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:533360/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:554209/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:245193/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:666689/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:701798/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:702286/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:738791/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:790128/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:797462/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:819825/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:849965/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:871336/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:899182/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:918234/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:934868/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:962059/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1535626/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1056378/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1140740/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1160926/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1173974/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1200348/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1201303/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1210471/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1297281/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1304702/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1356632/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1362249/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1385319/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1461657/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:279068/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1563445/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1632473/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1736343/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1741686/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1752022/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1752249/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1863570/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:222974/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:228430/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:237718/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:243181/65‑1 (MQ=255) aTAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGaa  <  1:1055864/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGAA  >  W3110S.gb/1669024‑1669088

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑