Missing coverage evidence...
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TTCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCCTCT  >  W3110S.gb/1678904‑1678967 |                                                                ttCCGCTTTGATGCACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1331415/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCt        >  1:59362/1‑58 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:575165/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1053930/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1801618/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:191845/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:231357/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:232571/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:351730/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:367548/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:420970/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:509154/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:547523/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1696670/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:615863/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:698560/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:720811/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:748335/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:779746/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:928408/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:958021/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:995115/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1362971/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1092256/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1107499/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1139531/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:114579/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1216457/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1283882/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1296078/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:132373/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1341477/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1401691/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1444498/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1481488/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1540336/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:1589962/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctct  >  1:159898/1‑64 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctc   >  1:1673496/1‑63 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctc   >  1:1467020/1‑63 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctc   >  1:1330422/1‑63 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctc   >  1:602838/1‑63 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctc   >  1:1577441/1‑63 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctc   >  1:204817/1‑63 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctc   >  1:841768/1‑63 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctc   >  1:1858191/1‑63 (MQ=255) ttCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCctc   >  1:1593427/1‑63 (MQ=255) |                                                                TTCCGCTTTGATGAACGCGTCCGACATCACTTTGGCATAGCCATCGCCGCTGCCAGCTTCCTCT  >  W3110S.gb/1678904‑1678967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑