Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1696621	1696725	105	24 [0]	[0] 65	uidA	beta‑D‑glucuronidase

CAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTAA  >  W3110S.gb/1696726‑1696790 |                                                                 cagcagTTTCATCAATCACCTCGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1423058/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:429037/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1685166/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1712140/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1717624/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1724497/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1726085/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1751892/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1758264/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:182086/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:207832/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:24525/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:254636/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:256591/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:337391/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:341678/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1646331/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:482036/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:534223/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:553143/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:560074/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:561795/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:571958/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:625494/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:641483/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:653388/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:667446/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:707336/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:708602/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:767184/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:869921/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:89759/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:116415/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1362517/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1319174/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1291970/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1258086/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1201757/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1200396/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1188565/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1186378/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1364491/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1163722/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1160017/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1119398/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1096043/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1072321/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1070598/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1052629/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1026832/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1382605/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1432793/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1433953/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1453577/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1461933/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1467669/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1484247/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1505919/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1516393/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1550271/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1559970/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:161562/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1632150/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTCCAGCGTaa  <  1:1815544/65‑1 (MQ=255) cagcagTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGCCGAGCATCTCTTCAGCGTaa  <  1:1686504/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTCAGCGTAA  >  W3110S.gb/1696726‑1696790

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑