BRESEQ :: Evidence

Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1700888	1700893	6	57 [0]	[0] 119	malI	DNA‑binding transcriptional repressor

Only 100 of 119 total aligned reads displayed.

TGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATACC > W3110S.gb/1700894‑1700958

tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATa                                >  1:1136501/1‑35 (MQ=255)

tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGtt                         >  1:1326517/1‑42 (MQ=255)

tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTtttattt            >  1:1070234/1‑55 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCtt       >  1:1397397/1‑60 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:457376/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:652612/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:647698/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:609494/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:603613/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:592201/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:562222/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:551814/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:524871/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:509723/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:483258/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:46570/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:684362/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:442737/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:432257/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:406270/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:384507/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:379038/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:374937/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:309267/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:283379/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:248756/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:247735/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:790549/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:984055/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:967481/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:960425/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:954704/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:953840/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:941169/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:930901/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:900288/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:886196/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:87451/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:830478/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:667642/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:776897/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:773423/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:766475/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:760230/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:759705/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:728513/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:72407/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:700891/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1033880/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:681404/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1238734/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1497371/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:145588/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1452962/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1446804/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1426221/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1386204/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1364986/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1345093/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1329834/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:130414/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1291362/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:209116/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1235338/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1216944/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1150345/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1147681/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1125242/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:111382/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1080348/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1062755/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1048046/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:10338/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1552269/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:209267/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1862830/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1854033/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:184414/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1828778/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1822798/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1819700/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1817918/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1787298/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1732124/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1786696/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1718492/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1717014/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1642544/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1531326/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1586019/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAcc  >  1:1582952/1‑65 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAc   >  1:9932/1‑64 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAc   >  1:987023/1‑64 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAc   >  1:1867717/1‑64 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAc   >  1:1866399/1‑64 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAc   >  1:371659/1‑64 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAc   >  1:935759/1‑64 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAc   >  1:1445219/1‑64 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAc   >  1:919144/1‑64 (MQ=255)
tGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATAc   >  1:1721519/1‑64 (MQ=255)

TGCAGATGACCTACTCCCTGATTATGTGACAGATAAAACGTTTTACCTTTTATTTATCTTATACC > W3110S.gb/1700894‑1700958

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`