Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1789019	1789122	104	21 [0]	[0] 50	pps/ydiA	phosphoenolpyruvate synthase/conserved hypothetical protein

TTCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGTTT  >  W3110S.gb/1789123‑1789186 |                                                                ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:751231/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:216289/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:244192/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:276402/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:279569/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:348897/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:352207/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:430597/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:492591/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:560258/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:573240/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:621103/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:650456/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1882126/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:765600/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:771478/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:785314/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:793465/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:837537/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:844043/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:889665/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:932957/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:946994/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:970273/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:999037/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1392273/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:103617/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:104321/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1070542/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1077422/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1126337/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1159481/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1166984/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1201267/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1203351/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1246768/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1269525/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1273458/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1022990/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1478291/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1556972/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1585074/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1646366/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1682508/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1684927/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1758283/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1805250/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1838174/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1865877/64‑1 (MQ=255) ttCATAGAATTATGTCTGCATCACCGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGttt  <  1:1711262/64‑1 (MQ=255) |                                                                TTCATAGAATTATGTCTGCATCACGGGAAGAACAAAATGGATAATGCTGTTGATCGCCACGTTT  >  W3110S.gb/1789123‑1789186

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑