Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1789657	1789678	22	5 [0]	[0] 78	ydiA	conserved hypothetical protein

TTGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCCGCG  >  W3110S.gb/1789679‑1789743 |                                                                 ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGc          >  1:1116403/1‑57 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:183950/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:428983/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:398879/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:3053/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:293861/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:218275/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:218164/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:187119/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1868503/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1855922/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:435361/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1837594/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1776366/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1760479/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1759867/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1044235/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1682911/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1682876/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:729481/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:965556/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:940260/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:930268/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:91186/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:876888/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:871446/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:791330/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:757734/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1707401/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:680570/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:657843/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:631804/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:601639/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:569027/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:513545/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:446475/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1227382/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1398570/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1681811/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1319943/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1299892/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1294465/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1286644/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1243148/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:12365/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1340815/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:122463/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1195178/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1150687/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1149227/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:112217/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1082282/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1058107/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1047320/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1681460/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1618867/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1593315/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1677367/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1576898/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1562921/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1511951/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1490555/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1466194/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1440387/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1678962/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgcg  >  1:1432284/1‑65 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:912787/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:1683685/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:1811908/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:901340/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:1134073/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:114854/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:806336/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:394262/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:1560901/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:28944/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:41501/1‑64 (MQ=255) ttGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCcgc   >  1:1428070/1‑64 (MQ=255) |                                                                 TTGGTATCCGCGCGGCAAACTACCCCTTTATTGCCGACGATATGGATAATCTGGTGCTACCCGCG  >  W3110S.gb/1789679‑1789743

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑