Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1821843 1821846 4 20 [0] [0] 91 chbC N,N'‑diacetylchitobiose‑specific enzyme IIC component of PTS

AACGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCT  >  W3110S.gb/1821847‑1821910
|                                                               
aaCGTGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1377052/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:273460/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:489106/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:479334/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:476188/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:434980/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:429150/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:422747/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:389425/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:362948/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:347786/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:319714/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:51032/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:260878/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:250375/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:232952/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:227654/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:219397/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:193931/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1880019/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1862735/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1821123/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:180577/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:67262/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:997740/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:982399/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:976597/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:947691/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:878879/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:875034/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:787649/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:778915/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:71996/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:696505/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:6798/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1676107/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:647473/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:646279/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:641987/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:637339/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:623926/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:612594/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:548216/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:542902/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:539881/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:5378/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1129631/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1311973/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1304036/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1296516/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1279070/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:12758/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1267295/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1262876/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1239477/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1189346/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1184279/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1160298/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1326589/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1098097/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1078001/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1072672/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1069506/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1057055/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1053997/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1051862/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1022992/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:102044/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1014366/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:149850/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1004889/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1675142/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1670409/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1657625/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1646688/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1598761/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1598679/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1553565/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1521009/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1518327/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1734209/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1477378/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1459579/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1436358/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:142586/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1394193/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1392608/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1389700/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1379685/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1357079/64‑1 (MQ=255)
aaCGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCt  <  1:1336862/64‑1 (MQ=255)
|                                                               
AACGGGATAAACATCACCGGGTTCATGATAATTGGCAGACCAAACAGAATCGGTTCGTTAATCT  >  W3110S.gb/1821847‑1821910

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: