Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1851013	1851201	189	22 [0]	[0] 61	sppA	protease IV

GATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTA  >  W3110S.gb/1851202‑1851266 |                                                                 gatgatATGTCCCCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:540752/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:571944/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1003763/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:235867/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:25331/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:271330/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:359182/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:373608/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:401029/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:430852/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:45260/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:462067/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:47113/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:481971/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:547909/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:218191/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:584103/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:641066/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:657515/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:723804/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:798359/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:806203/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:818223/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:818371/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:831704/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:835391/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:919235/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:939968/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:999937/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:159727/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1055387/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1065807/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1068920/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1138285/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:122611/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1269256/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1276327/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1385516/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1431654/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1476105/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1500057/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1532216/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1550518/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1859587/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:182162/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1848309/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1843565/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1831196/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1831175/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:182464/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1823393/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1612332/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1780869/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1745292/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1732537/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1709165/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1679423/65‑1 (MQ=255) gatgatATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:1614334/65‑1 (MQ=255) gatgatATGACACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGTAAAACTa  <  1:987851/65‑1 (MQ=255) gatgatATGACACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGTAAAACTa  <  1:990088/65‑1 (MQ=255) gatgatAAGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTa  <  1:456168/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGACAGCCGCTGGATTGGTGAGCTGTGGCAAAACTA  >  W3110S.gb/1851202‑1851266

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑