Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1968171	1968280	110	93 [0]	[0] 59	cheZ	chemotaxis regulator

CTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCCAT  >  W3110S.gb/1968281‑1968343 |                                                               cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:560793/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:305758/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:321457/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:335260/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:364192/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:367654/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:379696/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:407077/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:429280/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:46814/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:483250/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:501517/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:501690/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:533436/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:541682/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:285104/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:596202/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:620005/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:635955/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:694343/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:717732/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:725252/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:736438/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:857716/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:85963/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:88896/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:897637/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:910858/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:952626/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:965482/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1500998/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1075132/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:109006/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1177492/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1194613/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1214157/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1228332/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1241524/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1252435/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1273640/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1301732/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1304387/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1309575/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1413120/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1455633/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1037748/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:153446/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1559075/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1559431/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1563650/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1601459/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1624559/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1666741/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1689327/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:18226/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1831761/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:1834520/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:238370/63‑1 (MQ=255) cTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCcat  <  1:28098/63‑1 (MQ=255) |                                                               CTGAATGACATCCATCATCCGCTTAATGACCTGCCCGGTGAGATCCTGAAAATCCTGCGCCAT  >  W3110S.gb/1968281‑1968343

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑