Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1968906	1969079	174	98 [0]	[0] 16	cheY	chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component

CAGGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAT  >  W3110S.gb/1969080‑1969144 |                                                                 cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCa                              >  1:410985/1‑37 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:1390089/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:146652/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:1500493/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:1599354/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:1719592/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:174500/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:1796573/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:276127/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:336938/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:358401/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:419465/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:597931/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:973412/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAt  >  1:994702/1‑65 (MQ=255) cagGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTAAAGtt        >  1:455813/1‑59 (MQ=255) |                                                                 CAGGTTACGCACTATGCGTCGCATGGTGGAAAAGTCATCCACAACCAAAAATTTAAGTTCTTTAT  >  W3110S.gb/1969080‑1969144

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑