Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1979169	1979355	187	11 [0]	[0] 16	flhC	DNA‑binding transcriptional regulator with FlhD

TCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCAG  >  W3110S.gb/1979356‑1979420 |                                                                 tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGcc                          >  1:346581/1‑41 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCa   >  1:1062365/1‑64 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCa   >  1:1123694/1‑64 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCa   >  1:1188516/1‑64 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCa   >  1:1417585/1‑64 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCa   >  1:1496667/1‑64 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCa   >  1:1563196/1‑64 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCa   >  1:1877301/1‑64 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCa   >  1:222330/1‑64 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCAg  >  1:1079445/1‑65 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCAg  >  1:29041/1‑65 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCAg  >  1:625632/1‑65 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCAg  >  1:70008/1‑65 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCAg  >  1:7072/1‑65 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCAg  >  1:800711/1‑65 (MQ=255) tCCCAGGTCATAAACCAGTCCGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCAg  >  1:57180/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TCCCAGGTCATAAACCAGTCGGTTGAGAATGGCAGCATGCCTTTCGGCGGTGGGCTTCCGCGCAG  >  W3110S.gb/1979356‑1979420

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑