Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1998537	1998657	121	9 [0]	[0] 42	sdiA	DNA‑binding transcriptional activator

CTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCA  >  W3110S.gb/1998658‑1998722 |                                                                 cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTTCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1051492/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAATTTTTCAGGGTTCa  <  1:375528/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:642760/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:286140/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:43443/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:441456/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:456691/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:470915/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:490473/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:508147/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:57479/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:597712/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:237602/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:716952/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:762069/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:781864/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:803814/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:867241/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:91535/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:951032/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:977157/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:984585/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1551526/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1046428/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1170706/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1328189/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1351027/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1395008/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1426969/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1429655/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1457614/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1517610/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1018672/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1556877/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1620202/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1693327/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1762373/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1836684/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:1859313/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:205950/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:224977/65‑1 (MQ=255) cTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCa  <  1:236822/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CTGTGCTTCGCTGAATAAGTCATCATTCCACATTAAATGGCCCTGACTAAAGTTTTCAGGGTTCA  >  W3110S.gb/1998658‑1998722

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑