Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2005440	2005454	15	33 [0]	[0] 10	fliC	flagellar filament structural protein

CCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTG  >  W3110S.gb/2005455‑2005518 |                                                                ccGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTg  <  1:1058044/64‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTg  <  1:1218032/64‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTg  <  1:1445306/64‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTg  <  1:149551/64‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTg  <  1:1518063/64‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTg  <  1:1748321/64‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTg  <  1:290821/64‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTg  <  1:353922/64‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTGCGGTGGTCTg  <  1:549970/64‑1 (MQ=255) ccGGCAGTTCACGCACACGCTGTAAGGTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTg  <  1:1407543/64‑1 (MQ=255) |                                                                CCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGACAGCGCGCCTTCGGTGGTCTG  >  W3110S.gb/2005455‑2005518

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑