Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2025500	2025655	156	35 [0]	[0] 95	fliR	flagellar export pore protein

GCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGG  >  W3110S.gb/2025656‑2025720 |                                                                 gCAATTATCCATTTTTGTTATTTGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1701074/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTTACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:43383/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:314131/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:462502/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:460505/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:457788/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:435034/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:421227/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:395204/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:391095/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:387480/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:368103/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:468275/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:307164/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:306624/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:299279/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:29027/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:279023/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:271427/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:254276/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:253030/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:20669/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1883105/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1882972/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:865614/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:995823/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:988940/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:981966/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:971290/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:963918/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:955137/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:93828/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:930116/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:926401/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:894619/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:889552/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1847911/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:845044/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:827296/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:810938/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:787388/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:73051/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:696672/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:66185/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:645353/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:546931/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:541020/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:472794/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1253306/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1471611/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1463181/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1403502/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1399378/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:134814/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1347234/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1320789/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1315746/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1314544/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1288267/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1270913/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1473190/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1252770/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1188964/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1146914/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1141777/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1137335/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1127611/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1118653/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1106234/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:106823/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:104494/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1040167/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1709829/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1010839/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1818792/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1799697/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1797679/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1790706/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1787640/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1780607/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1764206/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1754678/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1726978/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:172282/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1881471/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1689269/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:16503/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1645856/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1620745/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1612831/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1609835/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:15914/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1552565/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1536674/65‑1 (MQ=255) gCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATggcgg  <  1:1487993/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGG  >  W3110S.gb/2025656‑2025720

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑