Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2076587	2076711	125	96 [0]	[0] 45	flu	antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

GTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCCAC  >  W3110S.gb/2076712‑2076776 |                                                                 gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:499480/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1754510/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1764180/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1878699/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:188189/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:214390/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:349625/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:372534/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:374544/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:399766/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:488753/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1647083/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:550677/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:606478/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:617596/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:821261/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:848151/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:876747/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:904132/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:915738/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:925657/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:966140/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1373654/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1049056/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1076535/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1100630/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1101268/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1119635/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1132224/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1156522/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1272164/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1281332/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1344122/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1372965/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1040422/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1448490/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1474485/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1474617/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1496671/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1562621/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1582842/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1584835/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1605922/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCcac  <  1:1622824/65‑1 (MQ=255) gTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGGCAGGCcac  <  1:1720084/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GTTCAGGCCGGTTATGCCCACAGCGTCAGCGGCAGCAGCGCTGAAGGGTATAACGGTCAGGCCAC  >  W3110S.gb/2076712‑2076776

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑