Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2145976	2146047	72	32 [0]	[0] 47	yegE	predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein

TTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTT  >  W3110S.gb/2146048‑2146112 |                                                                 tttACTTTCATTGTTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:222902/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:533775/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:180085/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1812936/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1815198/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:206749/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:311773/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:390018/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:425076/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:447293/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:483139/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:519647/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1784129/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:56040/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:592961/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:61067/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:625700/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:674564/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:768288/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:81555/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:824378/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:905208/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:984426/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:986368/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1448090/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1035461/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:105658/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1118283/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1138638/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1140162/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:118514/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1197262/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1209145/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1012553/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1476959/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1527573/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1551089/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1630461/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1639066/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1723239/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1744937/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1758356/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1772873/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:1776347/1‑65 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCtttt   >  1:1058410/1‑64 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCtttt   >  1:1053477/1‑64 (MQ=255) tttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCAGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCttttt  >  1:138325/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTT  >  W3110S.gb/2146048‑2146112

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑