Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2173777	2174150	374	81 [0]	[0] 40	[gatR]–[gatD]	[gatR],[gatR],[gatD]

CAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTAAA  >  W3110S.gb/2174151‑2174210 |                                                            cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCTGATGTTaaa  >  1:836041/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:517039/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1001536/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:200028/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:3000/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:323584/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:327538/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:362626/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:384457/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:386037/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:425021/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1831207/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:544756/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:636588/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:865370/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:880576/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:92286/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:935310/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:987401/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:989568/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1291602/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1011117/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1076790/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1156519/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1188597/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:119350/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1234668/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1268499/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1807281/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1379172/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1419668/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1501101/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1565060/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1679519/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1685753/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1761351/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1766807/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:1782621/1‑60 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaa   >  1:11385/1‑59 (MQ=255) cAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAAAATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTaaa  >  1:803964/1‑60 (MQ=255) |                                                            CAACTGCCGATAACCGTCAGCTCTTTACGCAATATTTTGCCAAACGTTGCCGATGTTAAA  >  W3110S.gb/2174151‑2174210

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑