Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2283459 2283541 83 16 [0] [0] 50 rsuA 16S rRNA pseudouridylate 516 synthase

CGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACA  >  W3110S.gb/2283542‑2283605
|                                                               
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTTATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1690819/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGTGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1787618/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:646665/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1857050/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:195171/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:249946/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:285820/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:293812/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:435579/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:506177/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:510639/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:55185/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:596899/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1841038/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:672083/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:68263/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:709335/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:71816/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:72281/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:739293/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:808459/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:853029/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:854988/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:869057/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:933940/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:947056/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1531498/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1047007/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1081338/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1089368/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1153578/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1158214/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1271376/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1305439/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1359752/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1364469/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1461025/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1485257/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1845938/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1538182/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:158585/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1658679/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1660746/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1707995/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1710676/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1763454/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:177108/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1831850/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1836025/64‑1 (MQ=255)
cGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACa  <  1:1026172/64‑1 (MQ=255)
|                                                               
CGCTACCGGTTCATCAAGAAAATAGAGCACCGTTGGGTGATCAGGGTCGTCCGTGGAGCAAACA  >  W3110S.gb/2283542‑2283605

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: