Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2316205 2316426 222 108 [0] [0] 180 ompC/rcsD outer membrane porin protein C/phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

Only 100 of 180 total aligned reads displayed.

ATTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGC  >  W3110S.gb/2316427‑2316491
|                                                                
atTAACTTTATTTATTACCGTTATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:214382/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGGTGc  <  1:77445/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:510523/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:535512/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:502820/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:489180/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:479997/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:470538/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:469310/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:422769/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:393320/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:385514/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:373930/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:368880/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:365103/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:33395/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:327556/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:324716/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:318521/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:287456/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:284288/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:228509/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:223003/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1861492/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1855725/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:181194/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:801208/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:996301/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:992044/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:9884/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:975290/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:972800/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:929753/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:917976/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:88906/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:886929/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:884205/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:834695/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1791787/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:769679/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:763132/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:742274/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:736090/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:717919/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:647083/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:624119/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:598834/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:560890/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:559118/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:540003/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1176499/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:129673/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1275354/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1260526/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1247865/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1247445/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1230400/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1227358/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1221318/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1218580/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1208361/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1192977/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1184409/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1315309/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1171737/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1151750/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1141840/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1126094/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1107110/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1098510/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1098455/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1079670/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1064711/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1042622/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:103557/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1534524/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1784026/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1781217/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1731810/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1711659/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:168558/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1660165/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1633180/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1605746/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:160088/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1578039/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1572303/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:153703/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1006125/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1507497/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1501111/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1491664/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1478397/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1448768/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1417943/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1395021/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1389444/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1381156/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:1344651/65‑1 (MQ=255)
atTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGc  <  1:132587/65‑1 (MQ=255)
|                                                                
ATTAACTTTATTTATTACCGTCATTCATTTCTGAATGTCTGTTTACCCCTATTTCAACCGGATGC  >  W3110S.gb/2316427‑2316491

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑