Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2317240	2317447	208	69 [0]	[0] 12	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

CGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCTT  >  W3110S.gb/2317448‑2317512 |                                                                 cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACAt                     >  1:358938/1‑46 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGcgt  >  1:1858295/1‑63 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGGtt  >  1:1411060/1‑65 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCtt  >  1:22730/1‑65 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCtt  >  1:441354/1‑65 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCtt  >  1:572181/1‑65 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCtt  >  1:925029/1‑65 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCtt  >  1:95473/1‑65 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCt   >  1:1131544/1‑64 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCt   >  1:1220997/1‑64 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCt   >  1:339483/1‑64 (MQ=255) cGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCt   >  1:353019/1‑64 (MQ=255) |                                                                 CGGTCATTACTTTACATTGCGTACTACCTTTAACCAGCCAGGACATCTGGCAACGGTCGTGGCTT  >  W3110S.gb/2317448‑2317512

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑