Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2319440 2319471 32 134 [0] [0] 171 rcsD phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

Only 100 of 171 total aligned reads displayed.

GTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTG  >  W3110S.gb/2319472‑2319535
|                                                               
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAattatt   >  1:848544/1‑63 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAattatt   >  1:371211/1‑63 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:380633/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:620242/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:536040/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:507774/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:465883/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:45935/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:450309/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:441785/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:437111/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:432797/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:406970/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:397429/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:644606/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:365553/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:354310/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:337341/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:332505/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:279674/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:247199/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:235594/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:224339/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:217961/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:208317/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:189304/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:885609/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:986579/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:97869/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:975197/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:973522/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:959728/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:942277/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:940688/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:92526/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:916867/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:901529/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:897111/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1842183/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:866732/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:859326/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:833493/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:817062/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:801650/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:783408/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:776093/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:751801/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:719057/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:666408/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:655065/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1225114/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1478169/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1471119/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1379001/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1357651/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1352286/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1327155/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1304016/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1298277/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1275127/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1263066/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1240761/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1240106/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1480351/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1202283/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1200930/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1196204/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1187142/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1169583/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1166880/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1100700/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1084438/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1080075/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1035006/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1014436/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1683356/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1825020/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1816391/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:180550/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1773837/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1762117/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1761904/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1745100/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1734436/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1734229/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1716826/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1697554/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1687263/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1008425/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1671531/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1646021/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1643809/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1642491/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1597845/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1587066/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1561963/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1552725/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1529714/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1504434/1‑64 (MQ=255)
gTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTg  >  1:1495723/1‑64 (MQ=255)
|                                                               
GTTATGTCAAGAGCTTGCTGTAGCAAGGTAGCCTATTACATGAACAATATGAACGTAATTATTG  >  W3110S.gb/2319472‑2319535

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑