Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2327964	2327990	27	30 [0]	[0] 97	atoC/atoD	fused response regulator of ato opeon, in two‑component system with AtoS/acetyl‑CoA:acetoacetyl‑CoA transferase, alpha subunit

AATCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTC  >  W3110S.gb/2327991‑2328055 |                                                                 aaTCCCCATCCACTTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:196829/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:628155/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:632156/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:612213/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:605459/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:577712/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:576899/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:549725/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:541511/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:502200/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:492727/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:478206/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:471007/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:470754/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:400062/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:358205/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:343904/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:332501/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:323330/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:305368/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:288853/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:281594/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:265514/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:263521/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:251673/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:838859/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:959554/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:946215/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:931073/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:930431/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:916694/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:916419/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:911513/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:878519/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:875891/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:855066/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:843120/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1854682/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:82021/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:781954/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:75925/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:754632/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:740686/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:727870/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:69527/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:669376/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:668620/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:659229/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:635449/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1184182/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1072888/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1309153/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:128769/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:128290/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1252946/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:125218/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1240734/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1233856/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1197160/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:119372/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1192457/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1337438/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1175278/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1167204/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1142458/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1135155/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1129911/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1119164/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1114702/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1113443/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1081836/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1075685/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1630855/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1826864/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1808787/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1782842/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1779718/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1770720/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1762820/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:175674/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1722327/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:167244/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:16492/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1367130/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1619388/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1607580/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1592380/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1592206/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1586575/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1557649/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1544074/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1471886/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1463275/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1383718/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1374834/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATCCAAATTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1109657/65‑1 (MQ=255) aaTCCCCATACACTTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTc  <  1:1147950/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AATCCCCATCCAATTTATCCCTTCATATTCAATTAGTTAAATAACTAAATCCAATAATCTCATTC  >  W3110S.gb/2327991‑2328055

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑