Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2353724	2353787	64	2 [0]	[0] 24	inaA	conserved hypothetical protein

GGGCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCA  >  W3110S.gb/2353788‑2353851 |                                                                gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1802034/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:992744/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:938091/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:847624/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:795387/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:768239/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:718640/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:662768/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:4967/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:381851/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1877666/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1004231/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1663294/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1656799/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1581892/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1538310/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1409931/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1390927/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1376820/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:132615/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1232133/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:1122107/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:111679/64‑1 (MQ=255) gggCATACCAGTCAGCAATGCAGATGAACCCCGCCATATCTTCACTCACCAGCAACGCTCGCCa  <  1:360821/64‑1 (MQ=255) |                                                                GGGCATACCAGTCAGCAATGCTGATGAACCCCGCCATATCTTCAGTCACCAGCAACGCTCGCCA  >  W3110S.gb/2353788‑2353851

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑