Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2479709	2479861	153	64 [0]	[0] 45	yfdQ	hypothetical protein

CGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGA  >  W3110S.gb/2479862‑2479926 |                                                                 cGTAAGTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:171093/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:609421/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:36159/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:370315/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:408754/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:442573/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:479288/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:495342/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:515286/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:532287/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:584451/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:589811/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:34174/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:621814/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:634401/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:671465/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:721291/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:774569/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:822275/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:870510/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:927183/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:93248/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:963072/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1515966/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1043280/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1045475/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1114345/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1121121/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1125569/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1177273/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1191841/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1278097/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1355479/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1390916/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:344122/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1551429/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1552408/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1666509/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1718156/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1860260/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1879257/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:292369/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:305342/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:1019447/65‑1 (MQ=255) cGTAACTCCCAGAAATCACTCGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGa  <  1:269374/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CGTAACTCCCAGAAATCACTGGCAGAATGGATTGAAGACTGGGCCGACTACCTTGTGGGCTTTGA  >  W3110S.gb/2479862‑2479926

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑