Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2500122	2500166	45	3 [0]	[0] 92	[ypdI]	[ypdI]

CAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGGGTGG  >  W3110S.gb/2500167‑2500229 |                                                               cAGCTTATTTTTATTGGTTTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1267870/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTGTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1221731/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATTCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1334871/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:605677/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:618138/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:594842/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:583147/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:56322/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:542089/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:515184/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:506451/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:47447/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:473694/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:46716/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:379044/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:355982/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:298704/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:284381/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:268665/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:26769/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:250951/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:245826/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:239124/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:231876/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:230240/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:820067/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:980807/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:95537/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:931931/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:930550/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:910812/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:907431/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:889518/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:841946/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:833151/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:829561/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:610737/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:791479/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:786678/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:710902/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:700850/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:686762/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:6477/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:625161/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:622822/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1031999/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:612013/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:115403/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1460428/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1416353/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1379075/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1328439/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1322048/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1294603/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1272816/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1232263/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1221943/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1204683/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:204270/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1153833/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1150391/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:114806/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1136260/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1127038/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1113229/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1091291/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1090013/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1018102/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1554435/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:225248/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:18810/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1871027/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1865564/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1860730/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1825372/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:179734/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:179683/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1791721/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1763107/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1638346/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1627828/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1626543/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1613404/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1603159/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1597984/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1580698/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1569570/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:1536819/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTACGggtgg  <  1:34386/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCAATTCGggtgg  <  1:1290132/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGGTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:992465/63‑1 (MQ=255) cAGCTTATTTTTATTGGTCTCTAATATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGggtgg  <  1:130895/63‑1 (MQ=255) |                                                               CAGCTTATTTTTATTGGTCTCTATTATGGCATGCAATGTTTTTGCATTTTCCATTTCGGGTGG  >  W3110S.gb/2500167‑2500229

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑