Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2500334	2500414	81	45 [0]	[0] 71	ypdI	predicted lipoprotein involved in colanic acid biosynthesis

GATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCAA  >  W3110S.gb/2500415‑2500477 |                                                               gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTctgatgctgat                  >  1:605651/1‑47 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGACCACCTGCCCaa  >  1:1382807/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACAGCTGCCCaa  >  1:1072413/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:321615/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:506489/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:420123/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:401517/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:396636/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:36122/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:342042/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:338913/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:557227/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:255315/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:246005/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:226704/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:218285/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:210100/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1875065/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:186324/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1854422/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:523141/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1845696/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:573070/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:576343/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:631330/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:638076/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:66616/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:699928/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:753641/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:756000/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:771403/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:806974/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:823210/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:90899/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:927433/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:986621/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1191782/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1412245/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1408239/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1405323/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1366452/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1356661/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1354858/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1294583/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1250064/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1436382/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1171443/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:116570/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1124274/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1072553/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1041171/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1029915/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:101999/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1018489/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1536718/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1000471/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1820676/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1819264/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1765377/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1714684/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1677575/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1664381/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1849705/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1534794/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1533407/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1532244/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1507336/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1498556/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1477946/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCaa  >  1:1453964/1‑63 (MQ=255) gATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCa   >  1:253708/1‑62 (MQ=255) |                                                               GATAGCGTCTTTCACATGGCAGGTGAACAATCATGTCTGATGCTGATGTGAACACCTGCCCAA  >  W3110S.gb/2500415‑2500477

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑