Missing coverage evidence...
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CCCTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGTC  >  W3110S.gb/200447‑200509 |                                                               cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:257438/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:998164/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:851631/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:843371/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:818760/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:766208/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:743460/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:648585/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:535539/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:533353/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:496500/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:437508/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:412937/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:358076/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:331337/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1011628/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1789533/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1768080/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1728789/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1670255/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1660610/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1655942/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1487721/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:145269/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1409958/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1323150/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1261243/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1216335/63‑1 (MQ=255) cccTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGtc  <  1:1121554/63‑1 (MQ=255) |                                                               CCCTCCGGTGCAAATGGGATGGTAAGGAGTTTATTGTGAAAAAGTGGTTATTAGCTGCAGGTC  >  W3110S.gb/200447‑200509

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑