Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,303,633 G→T Q246Y (CAG→TAT)  oppA → oligopeptide transporter subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,303,6330GT100.0% 600.2 / NA 158Q246Y (CAG→TAT) oppAoligopeptide transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (0/158);  total (0/158)

Only 100 of 158 total aligned reads displayed.

CCGACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGAA  >  W3110S.gb/1303595‑1303660
                                      |                           
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 cGACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGaa  <  1:174612/65‑1 (MQ=255)
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 cGACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa   <  1:1729543/64‑1 (MQ=255)
 cGACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCAGaa  <  1:601519/65‑1 (MQ=255)
  gACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGaa  <  1:1390655/64‑1 (MQ=255)
  gACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGaa  <  1:1229423/64‑1 (MQ=255)
  gACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGaa  <  1:10386/64‑1 (MQ=255)
                    gAAAACCGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGaa  <  1:868032/46‑1 (MQ=39)
                       atccGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGaa  <  1:1428486/41‑1 (MQ=37)
                          cGTTATTAACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGaa  <  1:1523890/40‑1 (MQ=38)
                              attaACTATGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGa   <  1:1342175/35‑1 (MQ=37)
                                      |                           
CCGACCTACTGGAACAACGCGAAAACCGTTATTAACCAGGTAACCTATTTGCCTATTGCTTCTGAA  >  W3110S.gb/1303595‑1303660

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑