Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	1,800,301	A→C	F119C (TTC→TGC)	pheS ←	phenylalanine tRNA synthetase, alpha subunit

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,800,301	0	A	C	100.0%	165.9 / NA	44	F119C (TTC→TGC)	pheS	phenylalanine tRNA synthetase, alpha subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (25/19);  total (25/19)

CTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGAAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAG  >  W3110S.gb/1800254‑1800341                                                |                                         cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:1061615/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:506577/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:521550/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:420685/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:57770/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:275788/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:197202/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:689824/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:1818130/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:787709/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:149665/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:1088696/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:1351462/65‑1 (MQ=255) cTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCg                         <  1:1280871/65‑1 (MQ=255) 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                       aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:557230/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:562831/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:655735/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:688165/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:741367/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:789490/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:79593/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:466998/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:45435/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:436573/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:387147/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:362630/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:296154/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:1860266/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:1848549/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:1769309/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:1737945/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:1721897/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:1583452/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:12531/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:1155778/1‑65 (MQ=255)                        aCGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGCAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAg  >  1:1118410/1‑65 (MQ=255)                                                |                                         CTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGAAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAG  >  W3110S.gb/1800254‑1800341

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑